Se pueden construir de muchas maneras, pero en todos ellos se cumple que el tiempo se representa en un eje vertical (en ese caso las especies finales están en la parte superior) o en un eje horizontal, y en tal caso las especies o taxones finales estarán a la derecha. También se cumple (y esto es quizá lo más importante) que dos especies o taxones finales están más estrechamente emparentados cuanto más reciente es su último antepasado común. Si queréis saber más y ejercitaros en construir estos árboles, visitad esta página y esta otra.
Aquí tenéis un pequeño muestrario de árboles filogenéticos:
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